在规范服用质子泵抑制剂的情况下，夜间有超过1小时的时间胃内pH值小于4.0，称为夜间酸突破。其具体发生机制尚不清楚。夜间酸突破可能会影响胃食管反流病患者的症状、严重糜烂性食管炎及Barrett食管的恢复。可以通过加大质子泵抑制剂剂量、调整给药方式以及睡前加服H ₂受体拮抗剂的方法进行处理。